Počet záznamů: 1
Comparison of intrinsic stacking energies of ten unique dinucleotide steps in A-RNA and B-DNA duplexes. Can we determine correct order of stability by quantum-chemical calculations?
- 1.
SYSNO ASEP 0338172 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Comparison of intrinsic stacking energies of ten unique dinucleotide steps in A-RNA and B-DNA duplexes. Can we determine correct order of stability by quantum-chemical calculations? Překlad názvu Srovnání stacking energií deseti dinukleotidových stepů v A-RNA a B-DNA duplexes. Můžeme správně určit pořadí stability pomocí kvantově chemických výpočtů? Tvůrce(i) Svozil, D. (CZ)
Hobza, Pavel (UOCHB-X) RID, ORCID
Šponer, Jiří (BFU-R) RID, ORCIDCelkový počet autorů 3 Zdroj.dok. Journal of Physical Chemistry B. - : American Chemical Society - ISSN 1520-6106
Roč. 114, č. 2 (2010), s. 1191-1203Poč.str. 13 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. US - Spojené státy americké Klíč. slova molecular dynamics ; quantum chemistry ; base pair step Vědní obor RIV BO - Biofyzika CEP LC512 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LC06030 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy IAA400040802 GA AV ČR - Akademie věd CEZ AV0Z50040507 - BFU-R (2005-2011) AV0Z50040702 - BFU-R (2007-2013) AV0Z40550506 - UOCHB-X (2005-2011) UT WOS 000273405000061 DOI 10.1021/jp910788e Anotace High level ab initio methods have been used to study stacking interactions in ten unique base pair steps both in A-RNA and in B-DNA duplexes. The protocol for selection of geometries based on molecular dynamics (MD) simulations is proposed, and its suitability is demonstrated by comparison with stacking in steps at fiber diffraction geometries. Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2010
Počet záznamů: 1