- transXpress: a Snakemake pipeline for streamlined de novo transcripto…
Počet záznamů: 1  

transXpress: a Snakemake pipeline for streamlined de novo transcriptome assembly and annotation

  1. 1.
    SYSNO0571021
    NázevtransXpress: a Snakemake pipeline for streamlined de novo transcriptome assembly and annotation
    Tvůrce(i) Fallon, T. R. (US)
    Čalounová, Tereza (UOCHB-X) [820/82] ORCID
    Mokrejš, Martin (UOCHB-X) [690/69]
    Weng, J. K. (US)
    Pluskal, Tomáš (UOCHB-X) [820/82] ORCID, RID
    Korespondující/seniorWeng, J. K. - Korespondující autor
    Pluskal, Tomáš - Korespondující autor
    Zdroj.dok. BMC Bioinformatics. Roč. 24, č. 1 (2023). - : BioMed Central
    Číslo článku133
    Druh dok.Článek v odborném periodiku
    Grant GM21-11563M GA ČR - Grantová agentura ČR, CZ - Česká republika
    891397, XE - země EU
    Institucionální podporaUOCHB-X - RVO:61388963
    Jazyk dok.eng
    Země vyd.GB
    Klíč.slova de novo transcriptome assembly * RNA-seq * non-model organisms * transcriptome annotation * differential expression analysis * reproducible software * high-performance computing
    Jiné zdrojehttps://doi.org/10.5281/zenodo.7380017
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR10362953
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR10583928
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRR10362954
    URLhttps://doi.org/10.1186/s12859-023-05254-8
    Trvalý linkhttps://hdl.handle.net/11104/0342339
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    10.1186s12859-023-05254-8.pdf11.9 MBVydavatelský postprintpovolen
     
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.