Density-functional, density-functional tight-binding, and wave-function calculations on biomolecular systems

0090271 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kubař, Tomáš - Jurečka, Petr - Černý, Jiří - Řezáč, Jan - Otyepka, M. - Valdes, Haydee - Hobza, Pavel
Density-functional, density-functional tight-binding, and wave-function calculations on biomolecular systems.
[Použití výpočetních metod založených na teorii funkcionálu hustoty pro studium biomolekulových soustav a srovnání s jinými kvantově-chemickými metodami.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 111, č. 26 (2007), s. 5642-5647. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA ČR GA203/05/0009
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: density functional theory * empirical dispersion-energy term * non-covalent interactions
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.918, rok: 2007

Two approaches combining density-functional-theory calculations with an empirical dispersion-energy term are investigated in terms of performance and usability in the studies of biomolecular systems. The interaction energy, structure and infrared spectra yielded for selected representative systems are found in a good agreement with reference data.

Na několika příkladech studií biomolekul jsme zkoumali přesnost a použitelnost metod založených na teorii funkcionálu hustoty a doplněných opravným členem pro disperzní energii. Interakční energie, struktura a infračervená spektra získaná pro reprezentativní zástupce biomolekulových soustav dobře souhlasí s referenčními daty.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004270