0025690 - PAU-O 2006 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gibson, W. C. - Lom, Jiří - Pecková, Hana - Ferris, V. R. - Hamilton, P. B.
Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA.
[Fylogenetická analýza trypanosom sladkovodních ryb Evropy využívající sekvence ssu rRNA genu a polymorfismus náhodně amplifikované DNA.]
Parasitology. Roč. 130, č. 4 (2005), s. 405-412. ISSN 0031-1820. E-ISSN 1469-8161
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60220518
Klíčová slova: trypanosomes * freshwater fish * phylogeny
Kód oboru RIV: EA - Morfologické obory a cytologie
Impakt faktor: 1.703, rok: 2005

A collection of 22 cloned trypanosome isolates from 14 species of European freshwater fish and 1 species of African freshwater fish were examined by phylogenetic analysis. SSU rRNA genes of 8 isolates were sequenced and compared with sequences from a wide selection of vertebrate trypanosome isolates. All freshwater isolates fell in a single clade, subdivided into 3 groups. This clade sits within a robust clade of trypanosomes from marine fish, amphibia, reptiles and the duck-billed platypus. All 22 trypanosome clones were analysed by RAPD. The resulting tree shows 3 groups congruent with the groups identified in the ssu rRNA gene phylogeny. Two of these groups contain the majority of isolates. These groups do not separate trypanosome species distinguished by morphology or host origin, and thus these criteria do not appear to be reliable guides to genetic relationships among fish trypanosomes. The two groups themselves may represent different species of fish trypanosomes.

Molekulárně fylogenetickými metodami bylo analyzováno 22 klonů trypanosom izolovaných ze 14 druhů sladkovodních ryb. SSU rRNA geny 8 klonů byly sekvenovány a porovnány se sekvencemi ssu rRNA genů trypanosom širšího souboru obratlovců. Všechny trypanosomy ze sladkovodních ryb spadly do jednoho kladu rozděleného na 3 skupiny. Tento klad je součástí většího robustního kladu obsahujícího trypanosomy mořských ryb a různých obojživelníků. Všech 22 klonů trypanosom bylo analyzováno metodou RAPD. Výsledný dendrogram ukazuje 3 skupiny, které jsou shodné se skupinami identifikovanými ve fylogenezi ssu rRNA genu. Dvě skupiny obsahují většinu izolátů trypanosom, rozdíly uvnitř skupin jsou jen malé. Tyto skupiny neoddělují druhy trypanosom rozlišené podle morfologie nebo původu hostitele. Použitá kritéria tedy nejsou spolehlivými vodítky pro zjišťování genetické příbuznosti rybích trypanosom. Výsledky práce naznačují, že 2 skupiny samy o sobě mohou představovat rozdílné druhy trypanosom ryb.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0116057