Počet záznamů: 1  

Calcium binding to calmodulin by molecular dynamics with effective polarization

  1. 1.
    0435514 - ÚOCHB 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Kohagen, Miriam - Lepšík, Martin - Jungwirth, Pavel
    Calcium binding to calmodulin by molecular dynamics with effective polarization.
    Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 5, č. 22 (2014), s. 3964-3969. ISSN 1948-7185
    Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016; GA MŠMT LH12001
    Institucionální podpora: RVO:61388963
    Klíčová slova: EF-hand motif * free energy calculations * charge scaling * calcium-binding protein * umbrella sampling
    Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
    Impakt faktor: 7.458, rok: 2014

    Calcium represents a key biological signaling ion with the EF-hand loops being its most prevalent binding motif in proteins. We show using molecular dynamics simulations with umbrella sampling that including electronic polarization effects via ionic charge rescaling dramatically improves agreements with experiment in terms of the strength of calcium binding and structures of the calmodulin binding sites. The present study thus opens way to accurate calculations of interactions of calcium and other computationally difficult high-charge-density ions in biological contexts.
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0239676

     
     
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.