Tools for 3D Visualization of Structures in Biology

0083717 - FGÚ 2008 RIV CZ eng K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Čapek, Martin - Janáček, Jiří - Kubínová, Lucie - Smrčka, P. - Hána, K.
Tools for 3D Visualization of Structures in Biology.
[Nástroje pro trojrozměrnou vizualizaci struktur v biologii.]
CTU Reports – Proceedings of Workshop 2007. Prague: Czech Technical University, 2007, s. 500-501. ISBN 978-80-01-03667-9.
[Workshop 2007. Praha (CZ), 19.02.2007-23.02.2007]
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA100110502; GA AV ČR(CZ) IAA500200510; GA ČR(CZ) GA304/05/0153
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50110509
Klíčová slova: 3D visualization * OpenGL * DirectX
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
http://workshop.cvut.cz

By consecutive scanning of layers of the biological specimen by a confocal microscope we obtain a stack of optical sections, i.e. a 3D digital representation of the specimen. Our research focuses, on volume reconstruction of large biological tissues, i.e. tissues greater than field of view and/or thicker than maximal depth of scanning of the confocal microscope. As a result of volume reconstruction we obtain a high resolution 3D image of the biological specimen. In order to visualize 3D objects on 2D computer screens we developed several tools including visualization by a specialized VolumePro board and by using consumer graphics cards supporting DirectX and OpenGL

Článek popisuje prostředky pro vizualizaci trojrozměrných skalárních dat získaných laserovým konfokálním mikroskopem z velkých biologických vzorků. Těmito prostředky jsou programy využívající PC kartu VolumePro firmy Terarecon, USA a běžné grafické karty podporující DirectX a OpenGL
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0146861