0024806 - ÚEB 2006 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hála, Michal - Eliáš, M. - Žárský, Viktor
A Specific Feature of the Angiosperm Rab Escort Protein (REP) and Evolution of the REP/GDI Superfamily.
[Specifická charakteristika Rab escort proteinu (REP) z vyšších rostlin a evoluce REP/GDI rodiny.]
Journal of Molecular Biology. Roč. 348, č. 5 (2005), s. 1299-1313. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA MŠMT LN00A081; GA AV ČR IAA5038907
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50380511
Klíčová slova: REP * Arabidopsis * Rab geranylgeranyl transferase
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 5.229, rok: 2005

Rab GTPases participating in the regulation of vesicle trafficking in eukaryotes are geranylgeranylated by the Rab geranylgeranyl transferase (RabGGTase) in complex with the Rab escort protein (REP). Here, we describe basic properties of the Arabidopsis thaliana REP (AthREP) mainly the N188 residue replacing the conserved arginine residue, R195, known to be crucial for yeast REP function. A point mutant allele of AthREP with arginine at this position complemented the yeast REP mutation, while wild-type AthREP did not. Based on phylogenetic analysis of REP and GDP dissociation inhibitor (GDI) sequences from a broad range of eukaryotic lineages, we propose a new view on evolution of the REP/GDI superfamily with a bi-functional REP/GDI protein as a direct ancestor.

GTPázy rodiny Rab účastnící se regulace transportu váčků v eukaryotické buňce jsou modifikovány Rab:geranylgeranyltransferázou (RabGGT) v součinnosti s Rab escort proteinem (REP). V tomto článku popisujeme základní vlastnosti REPu z Arabidopsis thaliana (AthREP), zejména důležitý asparagin v poloze 188, který v AthREPu nahrazuje arginin. Mutace tohoto Asn na Arg v sekvenci AthREP navodila schopnost komplementovat mutaci SceMrs6 v kvasinkách. V tomto článku také přinášíme rozsáhlou fylogenetickou analýzu REP/GDI rodiny a na jejím základě navrhujeme nově její evoluční schéma zahrnující bifunkční REP/GDI protein jako předchůdce současného REPu.
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0115293