Počet záznamů: 1
Isolating Chromosomes of the Komodo Dragon: New Tools for Comparative Mapping and Sequence Assembly
- 1.
SYSNO ASEP 0511982 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Isolating Chromosomes of the Komodo Dragon: New Tools for Comparative Mapping and Sequence Assembly Tvůrce(i) Iannucci, A. (IT)
Altmanová, Marie (UZFG-Y) ORCID
Ciofi, C. (IT)
Ferguson-Smith, M. A. (GB)
Pereira, J. (PT)
Řehák, I. (CZ)
Stanyon, R. (IT)
Velenský, P. (CZ)
Rovatsos, Michail (UZFG-Y) ORCID
Kratochvíl, L. (CZ)
Johnson Pokorná, Martina (UZFG-Y) ORCIDZdroj.dok. Cytogenetic and Genome Research. - : Karger - ISSN 1424-8581
Roč. 157, 1-2 (2019), s. 123-131Poč.str. 9 s. Forma vydání Tištěná - P Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CH - Švýcarsko Klíč. slova chromosome flow sorting ; laser capture ; microdissection Vědní obor RIV EG - Zoologie Obor OECD Zoology Způsob publikování Omezený přístup Institucionální podpora UZFG-Y - RVO:67985904 UT WOS 000466128800013 EID SCOPUS 85060205083 DOI 10.1159/000496171 Anotace We developed new tools to build a high-quality chromosomal map of the Komodo dragon (Varanus komodoensis) available for cross-species phylogenomic analyses. First, we isolated chromosomes by flow sorting and determined the chromosome content of each flow karyotype peak by FISH. We then isolated additional Komodo dragon chromosomes by microdissection and amplified chromosome-specific DNA pools. The chromosome-specific DNA pools can be sequenced, assembled, and mapped by next-generation sequencing technology. The chromosome-specific paint probes can be used to investigate karyotype evolution through cross-species chromosome painting. Overall, the set of chromosome-specific DNA pools of V. komodoensis provides new tools for detailed phylogenomic analyses of Varanidae and squamates in general. Pracoviště Ústav živočišné fyziologie a genetiky Kontakt Jana Zásmětová, knihovna@iapg.cas.cz, Tel.: 315 639 554 Rok sběru 2020 Elektronická adresa https://asep.lib.cas.cz/arl-cav/cs/csg/?repo=crepo1&key=41048410983
Počet záznamů: 1