Počet záznamů: 1  

Anaerobic fungal communities differ along the horse digestive tract

  1. 1.
    SYSNO ASEP0503750
    Druh ASEPJ - Článek v odborném periodiku
    Zařazení RIVJ - Článek v odborném periodiku
    Poddruh JČlánek ve WOS
    NázevAnaerobic fungal communities differ along the horse digestive tract
    Tvůrce(i) Mura, E. (IT)
    Edwards, B. (NL)
    Kittelmann, S. (DE)
    Kaerger, K. (DE)
    Voigt, K. (DE)
    Mrázek, Jakub (UZFG-Y) RID, ORCID
    Moniello, G. (IT)
    Fliegerová, Kateřina (UZFG-Y) RID, ORCID
    Zdroj.dok.Fungal Biology. - : Elsevier - ISSN 1878-6146
    Roč. 123, č. 3 (2019), s. 240-246
    Poč.str.7 s.
    Forma vydáníTištěná - P
    Jazyk dok.eng - angličtina
    Země vyd.GB - Velká Británie
    Klíč. slovaanaerobic fungi ; diversity ; equine hindgut
    Vědní obor RIVEE - Mikrobiologie, virologie
    Obor OECDMicrobiology
    CEPEF15_003/0000460 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
    Způsob publikováníOmezený přístup
    Institucionální podporaUZFG-Y - RVO:67985904
    UT WOS000461403100007
    EID SCOPUS85059307557
    DOI10.1016/j.funbio.2018.12.004
    AnotaceAnaerobic fungi are potent fibre degrading microbes in the equine hindgut, yet our understanding of their diversity and community structure is limited to date. In this preliminary work, using a clone library approach we studied the diversity of anaerobic fungi along six segments of the horse hindgut: caecum, right ventral colon (RVC), left ventral colon (LVC), left dorsal colon (LDC), right dorsal colon (RDC) and rectum. Of the 647 ITS1 clones, 61.7 % were assigned to genus level groups that are so far without any cultured representatives, and 38.0 % were assigned to the cultivated genera Neocallimastix (35.1 %), Orpinomyces (2.3 %), and Anaeromyces (0.6 %). AL1 dominated the group of uncultured anaerobic fungi, particularly in the RVC (88 %) and LDC (97 %). Sequences from the LSU clone library analysis of the LDC, however, split into two distinct phylogenetic clusters with low sequence identity to Caecomyces sp. (94-96 %) and Liebetanzomyces sp. (92 %) respectively. Sequences belonging to cultured Neocallimastix spp. dominated in LVC (81 %) and rectum (75.5 %). Quantification of anaerobic fungi showed significantly higher concentrations in RVC and RDC compared to other segments, which influenced the interpretation of the changes in anaerobic fungal diversity along the horse hindgut. These preliminary findings require further investigation.
    PracovištěÚstav živočišné fyziologie a genetiky
    KontaktJana Zásmětová, knihovna@iapg.cas.cz, Tel.: 315 639 554
    Rok sběru2020
    Elektronická adresahttps://asep.lib.cas.cz/arl-cav/cs/csg/?repo=crepo1&key=13449112003
Počet záznamů: 1  

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.